Станция «Байконыр» расположена в районе перекрестка ул. Байтурсынова и проспекта Абая.
Станция глубокого заложения колонного типа. Архитектурный образ станции связан с космодром Байконыр, стремлении покорить космос и выполнен в стиле хайтэк бело-синих тонах.
Платформенный участок состоит из трех залов - центрального и двух боковых. Залы образованы самостоятельными тоннелями односводчатого сечения между которыми устроены проходы шириной -3,0м. через -4,5м.
Для подъема и спуска маломобильных пассажиров смонтированы на лестницах подъемники в виде платформы.
Стены и своды - облицовываются алюминиевыми листами синего и белого цвета. Полы – гранитные плиты серого цвета.
Вестибюль ст. Байконыр расположен на отм. - ±0,000 между эскалаторным участком и пешеходными переходами.
На уровне кассового зала расположены - распределительный зал с торговым киоском, касса, помещение подсчета монет, комната начальника станций, помещение охраны, и санузлы. А также технические:
Стены вестибюля облицовываются керамическими плитками. Полы - гранит серого цвета. Потолок - реечный подвесной потолок «Люксалон».